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上海miRNA測序實驗外包

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上海miRNA測序實驗外包

miRNA 測序是研究特定組織在特定狀態下的已知miRNA,分析預測新的miRNA,并對已知 miRNA 和新miRNA進行靶基因預測。通過對miRNA靶基因注釋及代謝通路分析,將鑒定出的 miRNA與相應表型差異關聯起來,為研究miRNA對細胞進程的作用及其生物學影響提供了有力的工具。

上海miRNA測序實驗外包生物信息分析內容

1、數據產出統計和質量評估

2、sRNA在參考基因組上的分布

3、sRNA分類注釋統計

4、堿基偏好性分析

5、基因表達水平分析

6、新轉錄本預測

7、差異miRNA靶基因預測

8、差異基因篩選及聚類分析

9、差異表達miRNA靶基因GO富集分析

10、差異表達miRNA靶基因Pathway富集分析

11、差異表達miRNA靶基因蛋白互作網絡分析

 

技術參數

樣本類型:total RNA

樣本要求:總量≥3 μg,濃度≥200 ng/μL

文庫類型:Small RNA文庫

測序策略:HiSeq SE50,推薦數據量:≥10M reads

項目周期:35個工作日

 

結果示例

樣本已知miRNA各位置堿基偏好性

 

新miRNA二級結構及reads mapping示意圖

 

各個樣本之間共有novel miRNA分布

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